辟谷对于经历者没有多大难度，但对于新手还是有一定挑战，这些挑战主要来自以下几个方面。
担心无法抵挡住口腹之欲
“口腹之欲”是几十年的习惯。普通人习惯于每日三餐往肠胃里塞满食物，一旦肠胃空虚，就会感觉 “饥饿 “，其实这不是身体真的需要食物，而是欲望上的不习惯而已。
以我们的实践经验，有部分初次辟谷者在第3-4天中会有些不适应感，这时候你的身体会感觉有些难受，有发软、饿的感觉。其实这并不是真的饿，一方面是因为你的身体正在实现大转换，在经历一个习惯不进食的适应过程，是能量采集系统的大转换交接，另一方面也是身体里的寄生虫在造反，它们得不到食物会折腾，如果继续下去它们长时间得不到食物，它们就不再在体内继续生活，就会大搬家而随着粪便排出体外，这当然是好事。
辟谷几天之后，人的嗅觉会变得特别敏感。比如走在街上，远远地就能闻到饭馆里传来的饭菜香，其实这些味道是你平时根本没法体会的。而且你可能会有想吃的欲望，记住！这只是习惯性的欲望而已，不是身体的真实需求。这时候就要考验你的定力了，如果把持不住自己去吃了，辟谷就破功了，如果能坚持不为所动，则不仅是辟谷的成功，也是自己定力的提升。
担心辟谷会给身体造成损伤
普通人没有经历过辟谷，甚至对辟谷几无了解，会对辟谷有害怕心理。一般都会觉得自己很多天不吃饭是件很难以置信的事，担心自己会出问题，会不会饿死、会不会有后遗症等等这样的问题。在辟谷前这种心理压力转成心理暗示，进一步不敢尝试。其实一脚踏入后的初次辟谷实践者，反倒没有这些顾虑了，因为他体会到了一种新的奇妙生活。
在辟谷中会有一些生理反应，比如头晕、口臭口苦、四肢无力、喉咙痒、咳嗽、打嗝、放屁、尿色深、或者原来身体有疾病的病灶部位会有些反应等等，其实这些都是身体病灶反应，是在排毒、排湿排寒等的现象，这是好事，是把身体深层次的慢性病灶挖掘出来了。维持时间，因人而异，不必害怕。
担心不被家人和朋友理解
一般人是不理解辟谷的，甚至有人认为辟谷是疯狂的做法，所以辟谷还有一大障碍，就是消除亲友的思想顾虑。当家人或朋友知道你辟谷后，有可能会阻止你，这时候建议不要采取对抗的做法，可以先随顺他们，并慢慢让他们去了解辟谷的好处和方法、合理性，直到他们支持你甚至与你一起辟谷。
如果有人给你讲辟谷，你要看他本人是否真正断食辟谷过，如果他本人都不曾辟谷，或者没有传承，他所说的道理不过是道听途说而已，是有风险的。真正辟谷是怎么回事，好不好，建议去问那些实实在在经历过辟谷的人。最重要的是初学辟谷的人一定要在有丰富实践经验的先行者指导下进行，不要盲目自己尝试，方法或应对失当，留下后遗症就得不偿失了。